Екипът от специалисти в отделението по гастроентерология е отдаден на ранната диагностика, неоперативни и медикаментозни терапии, както и превенция на болести на стомашно-чревния тракт.

Лекарите в отделението са специализирани в заболяванията на стомашно - чревния тракт, жлъчния мехур и панкреаса като язва на стомах, на дванадесeтопръстник, тумори, болестни състояния на чревния тракт и нарушения в храносмилането.

Прилагат се ендоскопски методи на диагностициране - гастроскопия или колоноскопия. При коремната хирургия лекарите в Св. Панталеймон работят по лапароскопски метод, без разрез, което намалява престоя на пациентите в болницата до два дни.